source: trunk/CrossPareConfigurationBuilder/src/de/ugoe/cs/crosspare/ConfigurationBuilder.java @ 134

Last change on this file since 134 was 133, checked in by sherbold, 8 years ago
  • updated script for benchmark configuration generation
  • Property svn:mime-type set to text/plain
File size: 27.0 KB
Line 
1package de.ugoe.cs.crosspare;
2
3import java.io.FileWriter;
4import java.io.IOException;
5import java.lang.reflect.InvocationTargetException;
6import java.security.InvalidParameterException;
7
8public class ConfigurationBuilder {
9   
10    private static enum Dataset {MDP, JURECZKO, FILTERJURECZKO, AEEEM, RELINK, NETGENE, SELECTEDJURECZKO};
11   
12    private static final String storageFolder = "config/";
13   
14    public static void main(String[] args) {
15        for( Dataset dataset : Dataset.values() ) {
16            // baselines
17            writeFile("ALL", dataset);
18            writeFile("CV", dataset);
19            writeFile("Random", dataset);
20            writeFile("Trivial", dataset);
21            // publications
22            writeFile("Koshgoftaar08", dataset);
23            writeFile("Watanabe08", dataset);
24            writeFile("Turhan09", dataset);
25            writeFile("Zimmermann09", dataset);
26            writeFile("CamargoCruz09", dataset);
27            writeFile("Liu10", dataset);
28            writeFile("Menzies11", dataset);
29            writeFile("Ma12", dataset);
30            writeFile("Peters12", dataset);
31            writeFile("Uchigaki12", dataset);
32            writeFile("Canfora13", dataset);
33            writeFile("Peters13", dataset);
34            writeFile("Herbold13", dataset);
35            writeFile("ZHe13", dataset);
36            writeFile("Nam13", dataset);
37            writeFile("Panichella14", dataset);
38            writeFile("Ryu14", dataset);
39            writeFile("PHe15", dataset);
40            writeFile("Peters15", dataset);
41            writeFile("Kawata15", dataset);
42            writeFile("YZhang15", dataset);
43            writeFile("Amasaki15", dataset);
44            writeFile("Ryu15", dataset);
45            writeFile("Nam15", dataset);
46        }
47    }
48   
49    public static void writeFile(String approach, Dataset dataset) {
50        FileWriter writer;
51        try {
52            writer = new FileWriter(storageFolder + dataset.toString() + "-" + approach + ".xml");
53            writer.append((String) ConfigurationBuilder.class.getMethod(approach, Dataset.class).invoke(null, dataset));
54            writer.flush();
55            writer.close();
56        }
57        catch (IOException | IllegalAccessException | IllegalArgumentException | InvocationTargetException | NoSuchMethodException | SecurityException e) {
58            e.printStackTrace();
59        }
60    }
61   
62    public static void preamble(StringBuilder configFile) {
63        configFile.append("<?xml version=\"1.0\" encoding=\"UTF-8\"?>\n");
64        configFile.append("<config xmlns=\"experimentconfig\" xmlns:xsi=\"http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance\" xsi:schemaLocation=\"experimentconfig experimentconfig.xsd\">\n");
65    }
66   
67    public static void postamble(StringBuilder configFile) {
68        configFile.append(" <storage name=\"MySQLResultStorage\" param=\"\" />\n");
69        configFile.append("</config>");
70    }
71   
72    public static void trainers(StringBuilder configFile) {
73        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"NB weka.classifiers.bayes.NaiveBayes\" />\n");
74        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"RF weka.classifiers.trees.RandomForest -CVPARAM I 5 25 5\" />\n");
75        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"DT weka.classifiers.trees.J48 -CVPARAM C 0.1 0.3 5\" />\n");
76        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"LR weka.classifiers.functions.Logistic\" />\n");
77        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"NET weka.classifiers.functions.RBFNetwork -CVPARAM W 0.1 10.0 3.0 L 2.0 18.0 3.0\" />\n");
78        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"SVM weka.classifiers.functions.SMO -K weka.classifiers.functions.supportVector.RBFKernel\" />\n");
79    }
80   
81    public static void trainersBagging(StringBuilder configFile) {
82        configFile.append(" <setwisetrainer name=\"WekaBaggingTraining\" param=\"NB weka.classifiers.bayes.NaiveBayes\" />\n");
83        configFile.append(" <setwisetrainer name=\"WekaBaggingTraining\" param=\"RF weka.classifiers.trees.RandomForest -CVPARAM I 5 25 5\" />\n");
84        configFile.append(" <setwisetrainer name=\"WekaBaggingTraining\" param=\"DT weka.classifiers.trees.J48 -CVPARAM C 0.1 0.3 5\" />\n");
85        configFile.append(" <setwisetrainer name=\"WekaBaggingTraining\" param=\"LR weka.classifiers.functions.Logistic\" />\n");
86        configFile.append(" <setwisetrainer name=\"WekaBaggingTraining\" param=\"NET weka.classifiers.functions.RBFNetwork -CVPARAM W 0.1 10.0 3.0 L 2.0 18.0 3.0\" />\n");
87        configFile.append(" <setwisetrainer name=\"WekaBaggingTraining\" param=\"SVM weka.classifiers.functions.SMO -K weka.classifiers.functions.supportVector.RBFKernel\" />\n");
88    }
89   
90    public static void trainersLocalWhere(StringBuilder configFile) {
91        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLocalFQTraining\" param=\"NB weka.classifiers.bayes.NaiveBayes\" />\n");
92        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLocalFQTraining\" param=\"RF weka.classifiers.trees.RandomForest -CVPARAM I 5 25 5\" />\n");
93        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLocalFQTraining\" param=\"DT weka.classifiers.trees.J48 -CVPARAM C 0.1 0.3 5\" />\n");
94        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLocalFQTraining\" param=\"LR weka.classifiers.functions.Logistic\" />\n");
95        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLocalFQTraining\" param=\"NET weka.classifiers.functions.RBFNetwork -CVPARAM W 0.1 10.0 3.0 L 2.0 18.0 3.0\" />\n");
96        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLocalFQTraining\" param=\"SVM weka.classifiers.functions.SMO -K weka.classifiers.functions.supportVector.RBFKernel\" />\n");
97        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLocalFQTraining\" param=\"WHICH de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.WHICH\" />\n");
98    }
99   
100    public static void trainersLASER(StringBuilder configFile) {
101        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLASERTraining\" param=\"NB weka.classifiers.bayes.NaiveBayes\" />\n");
102        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLASERTraining\" param=\"RF weka.classifiers.trees.RandomForest -CVPARAM I 5 25 5\" />\n");
103        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLASERTraining\" param=\"DT weka.classifiers.trees.J48 -CVPARAM C 0.1 0.3 5\" />\n");
104        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLASERTraining\" param=\"LR weka.classifiers.functions.Logistic\" />\n");
105        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLASERTraining\" param=\"NET weka.classifiers.functions.RBFNetwork -CVPARAM W 0.1 10.0 3.0 L 2.0 18.0 3.0\" />\n");
106        configFile.append(" <trainer name=\"WekaLASERTraining\" param=\"SVM weka.classifiers.functions.SMO -K weka.classifiers.functions.supportVector.RBFKernel\" />\n");
107    }
108       
109    public static void dataset(StringBuilder configFile, Dataset dataset) {
110        switch (dataset)
111        {
112            case MDP:
113                configFile.append(" <loader name=\"NasaARFFFolderLoader\" datalocation=\"benchmark/data/MDP\" relative=\"false\"/>\n");
114                break;
115            case JURECZKO:
116                configFile.append(" <loader name=\"CSVFolderLoader\" datalocation=\"benchmark/data/JURECZKO\" relative=\"false\"/>\n");
117                break;
118            case FILTERJURECZKO:
119                configFile.append(" <loader name=\"CSVFolderLoader\" datalocation=\"benchmark/data/JURECZKO\" relative=\"false\"/>\n");
120                configFile.append(" <versionfilter name=\"MinInstanceNumberFilter\" param=\"100\" />\n");
121                configFile.append(" <versionfilter name=\"UnbalancedFilter\" param=\"0.05\" />\n");
122                break;
123            case AEEEM:
124                configFile.append(" <loader name=\"ARFFFolderLoader\" datalocation=\"benchmark/data/AEEEM\" relative=\"false\"/>\n");
125                break;
126            case RELINK:
127                configFile.append(" <loader name=\"RelinkFolderLoader\" datalocation=\"benchmark/data/RELINK\" relative=\"false\"/>\n");
128                break;
129            case NETGENE:
130                configFile.append(" <loader name=\"NetgeneFolderLoader\" datalocation=\"benchmark/data/NETGENE\" relative=\"false\"/>\n");
131                break;
132            case SELECTEDJURECZKO:
133                configFile.append(" <loader name=\"CSVFolderLoader\" datalocation=\"benchmark/data/SELECTEDJURECZKO\" relative=\"false\"/>\n");
134                break;
135            default:
136                throw new InvalidParameterException("Unknown data set: " + dataset.toString());
137        }
138        configFile.append(" <versionfilter name=\"MinClassNumberFilter\" param=\"5\" />\n");
139        configFile.append(" <resultspath path=\"benchmark/results-csv\"/>\n");
140    }
141   
142    public static String ALL(Dataset dataset) {
143        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
144        preamble(configFile);
145        dataset(configFile, dataset);
146        trainers(configFile);
147       
148        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
149       
150        postamble(configFile);
151        return configFile.toString();
152    }
153   
154    public static String CV(Dataset dataset) {
155        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
156        preamble(configFile);
157        dataset(configFile, dataset);
158        trainers(configFile);
159       
160        configFile.append(" <eval name=\"CVWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
161       
162        postamble(configFile);
163        return configFile.toString();
164    }
165   
166    public static String Random(Dataset dataset) {
167        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
168        preamble(configFile);
169        dataset(configFile, dataset);
170       
171        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"RANDOM de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.RandomClass\" />\n");
172        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
173        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
174       
175        postamble(configFile);
176        return configFile.toString();
177    }
178   
179    public static String Trivial(Dataset dataset) {
180        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
181        preamble(configFile);
182        dataset(configFile, dataset);
183       
184        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"FIX de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.FixClass -C 1\" />\n");
185        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
186       
187        postamble(configFile);
188        return configFile.toString();
189    }
190   
191    public static String Koshgoftaar08(Dataset dataset) {
192        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
193        preamble(configFile);
194        dataset(configFile, dataset);
195        trainersBagging(configFile);
196       
197        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
198       
199        postamble(configFile);
200        return configFile.toString();
201    }
202   
203    public static String Watanabe08(Dataset dataset) {
204        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
205        preamble(configFile);
206        dataset(configFile, dataset);
207        trainers(configFile);
208       
209        configFile.append(" <setwisepreprocessor name=\"AverageStandardization\" param=\"\" />\n");       
210        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
211       
212        postamble(configFile);
213        return configFile.toString();
214    }
215   
216    public static String Turhan09(Dataset dataset) {
217        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
218        preamble(configFile);
219        dataset(configFile, dataset);
220        trainers(configFile);
221       
222        configFile.append(" <preprocessor name=\"LogarithmTransform\" param=\"\" />\n");
223        configFile.append(" <pointwiseselector name=\"TurhanFilter\" param=\"10\" />\n");
224        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
225       
226        postamble(configFile);
227        return configFile.toString();
228    }
229   
230    public static String Zimmermann09(Dataset dataset) {
231        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
232        preamble(configFile);
233        dataset(configFile, dataset);
234        trainers(configFile);
235       
236        configFile.append(" <setwiseselector name=\"DecisionTreeSelection\" param=\"max median stddev\" />\n");
237        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
238       
239        postamble(configFile);
240        return configFile.toString();
241    }
242   
243    public static String CamargoCruz09(Dataset dataset) {
244        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
245        preamble(configFile);
246        dataset(configFile, dataset);
247        trainers(configFile);
248       
249        configFile.append(" <preprocessor name=\"LogarithmTransform\" param=\"\" />\n");
250        configFile.append(" <preprocessor name=\"MedianAsReference\" param=\"10\" />\n");
251        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
252       
253        postamble(configFile);
254        return configFile.toString();
255    }
256   
257    public static String Liu10(Dataset dataset) {
258        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
259        preamble(configFile);
260        dataset(configFile, dataset);
261       
262        configFile.append(" <setwisetrainer name=\"GPTraining\" param=\"numberRuns:1,errorType2Weight:15\" />");
263        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
264        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
265       
266        postamble(configFile);
267        return configFile.toString();
268    }
269   
270    public static String Menzies11(Dataset dataset) {
271        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
272        preamble(configFile);
273        dataset(configFile, dataset);
274       
275        trainersLocalWhere(configFile);       
276        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
277        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
278       
279        postamble(configFile);
280        return configFile.toString();
281    }
282   
283    public static String Ma12(Dataset dataset) {
284        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
285        preamble(configFile);
286        dataset(configFile, dataset);
287        trainers(configFile);
288       
289        configFile.append(" <preprocessor name=\"DataGravitation\" param=\"\" />\n");
290        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
291       
292        postamble(configFile);
293        return configFile.toString();
294    }
295   
296    public static String Peters12(Dataset dataset) {
297        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
298        preamble(configFile);
299        dataset(configFile, dataset);
300        trainers(configFile);
301       
302        configFile.append(" <preprocessor name=\"MORPH\" param=\"\" />\n");
303        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
304        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
305       
306        postamble(configFile);
307        return configFile.toString();
308    }
309   
310    public static String Uchigaki12(Dataset dataset) {
311        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
312        preamble(configFile);
313        dataset(configFile, dataset);
314       
315        configFile.append(" <preprocessor name=\"ZScoreNormalization\" param=\"\" />\n");
316        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"LE de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.LogisticEnsemble\" />\n");
317        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
318       
319        postamble(configFile);
320        return configFile.toString();
321    }
322   
323    public static String Canfora13(Dataset dataset) {
324        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
325        preamble(configFile);
326        dataset(configFile, dataset);
327       
328        configFile.append(" <preprocessor name=\"ZScoreNormalization\" param=\"\" />\n");
329        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"MODEP de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.MODEPClassifier -R 0.7\" />\n");
330        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
331        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
332       
333        postamble(configFile);
334        return configFile.toString();
335    }
336   
337    public static String Peters13(Dataset dataset) {
338        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
339        preamble(configFile);
340        dataset(configFile, dataset);
341        trainers(configFile);
342       
343        configFile.append(" <preprocessor name=\"MORPH\" param=\"\" />\n");
344        configFile.append(" <pointwiseselector name=\"CLIFF\" param=\"0.40\" />");
345        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
346        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
347       
348        postamble(configFile);
349        return configFile.toString();
350    }
351   
352    public static String Herbold13(Dataset dataset) {
353        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
354        preamble(configFile);
355        dataset(configFile, dataset);
356        trainers(configFile);
357       
358        int numNeighbors;
359        switch (dataset)
360        {
361            case AEEEM:
362                numNeighbors = 2;
363                break;
364            case MDP:
365                numNeighbors = 5;
366                break;
367            case JURECZKO:
368                numNeighbors = 30;
369                break;
370            case FILTERJURECZKO:
371                numNeighbors = 20;
372                break;
373            case RELINK:
374                numNeighbors = 1;
375                break;
376            case NETGENE:
377                numNeighbors = 1;
378                break;
379            case SELECTEDJURECZKO:
380                numNeighbors = 4;
381                break;
382            default:
383                numNeighbors = 10;
384                break;
385        }
386       
387        configFile.append(" <setwisepreprocessor name=\"Normalization\" param=\"\" />\n");
388        configFile.append(" <setwiseselector name=\"SetWiseKNNSelection\" param=\""+ numNeighbors +"\" />\n");
389        configFile.append(" <postprocessor name=\"BiasedWeights\" param=\"0.5\" />\n");
390        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
391       
392        postamble(configFile);
393        return configFile.toString();
394    }
395   
396    public static String ZHe13(Dataset dataset) {
397        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
398        preamble(configFile);
399        dataset(configFile, dataset);
400        trainersBagging(configFile);
401       
402        int numNeighbors;
403        switch (dataset)
404        {
405            case AEEEM:
406                numNeighbors = 1;
407                break;
408            case MDP:
409                numNeighbors = 4;
410                break;
411            case JURECZKO:
412                numNeighbors = 16;
413                break;
414            case FILTERJURECZKO:
415                numNeighbors = 13;
416                break;
417            case RELINK:
418                numNeighbors = 1;
419                break;
420            case NETGENE:
421                numNeighbors = 1;
422                break;
423            case SELECTEDJURECZKO:
424                numNeighbors = 4;
425                break;
426            default:
427                numNeighbors = 10;
428                break;
429        }
430       
431        configFile.append(" <setwisepreprocessor name=\"Normalization\" param=\"\" />\n");
432        configFile.append(" <setwiseselector name=\"SeparatabilitySelection\" param=\"" + numNeighbors + "\" />\n");
433        configFile.append(" <setwisepostprocessor name=\"Undersampling\" param=\"\" />\n");
434        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
435        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
436       
437        postamble(configFile);
438        return configFile.toString();
439    }
440   
441    public static String Nam13(Dataset dataset) {
442        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
443        preamble(configFile);
444        dataset(configFile, dataset);
445        trainers(configFile);
446       
447        configFile.append(" <preprocessor name=\"TCAPlusNormalization\" param=\"\" />\n");
448        configFile.append(" <postprocessor name=\"TransferComponentAnalysis\" param=\"\" />\n");
449        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
450       
451        postamble(configFile);
452        return configFile.toString();
453    }
454   
455    public static String Panichella14(Dataset dataset) {
456        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
457        preamble(configFile);
458        dataset(configFile, dataset);
459       
460        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"CODEP-LR de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.LogisticCODEP\" />\n");
461        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"CODEP-BN de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.BayesNetCODEP\" />\n");
462        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
463       
464        postamble(configFile);
465        return configFile.toString();
466    }
467   
468    public static String Ryu14(Dataset dataset) {
469        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
470        preamble(configFile);
471        dataset(configFile, dataset);
472       
473        configFile.append(" <preprocessor name=\"ZScoreNormalization\" param=\"\" />\n");
474        configFile.append(" <testawaretrainer name=\"WekaTestAwareTraining\" param=\"VCBSVM de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.VCBSVM -L 0.1 -B 10\" />\n");
475        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
476        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
477       
478        postamble(configFile);
479        return configFile.toString();
480    }
481   
482    public static String PHe15(Dataset dataset) {
483        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
484        preamble(configFile);
485        dataset(configFile, dataset);
486        trainers(configFile);
487       
488        configFile.append(" <setwisepreprocessor name=\"LogarithmTransform\" param=\"\" />\n");
489        configFile.append(" <setwisepreprocessor name=\"TopMetricFilter\" param=\"\" />\n");
490        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
491       
492        postamble(configFile);
493        return configFile.toString();
494    }
495   
496    public static String Peters15(Dataset dataset) {
497        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
498        preamble(configFile);
499        dataset(configFile, dataset);
500        trainers(configFile);
501       
502        configFile.append(" <setwisepreprocessor name=\"LogarithmTransform\" param=\"\" />\n");
503        configFile.append(" <setwiseselector name=\"LACE2\" param=\"0.4\" />\n");
504        configFile.append(" <pointwiseselector name=\"TurhanFilter\" param=\"1\" />\n");
505        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
506        configFile.append(" <repetitions number=\"10\" />\n");
507       
508        postamble(configFile);
509        return configFile.toString();
510    }
511   
512    public static String Kawata15(Dataset dataset) {
513        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
514        preamble(configFile);
515        dataset(configFile, dataset);
516        trainers(configFile);
517       
518        configFile.append(" <pointwiseselector name=\"DBSCANFilter\" param=\"\" />\n");
519        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
520       
521        postamble(configFile);
522        return configFile.toString();
523    }
524   
525    public static String YZhang15(Dataset dataset) {
526        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
527        preamble(configFile);
528        dataset(configFile, dataset);
529       
530        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"AVGVOTE weka.classifiers.meta.Vote -S 1 -B &quot;weka.classifiers.trees.ADTree&quot; -B &quot;de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.DecisionTableWrapper&quot; -B &quot;de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.BayesNetWrapper&quot; -B &quot;weka.classifiers.functions.MultilayerPerceptron&quot; -B &quot;weka.classifiers.functions.RBFNetwork&quot; -R AVG\" />\n");
531        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"MAXVOTE weka.classifiers.meta.Vote -S 1 -B &quot;weka.classifiers.trees.ADTree&quot; -B &quot;de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.DecisionTableWrapper&quot; -B &quot;de.ugoe.cs.cpdp.wekaclassifier.BayesNetWrapper&quot; -B &quot;weka.classifiers.functions.MultilayerPerceptron&quot; -B &quot;weka.classifiers.functions.RBFNetwork&quot; -R MAX\" />\n");
532        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"BAG-DT weka.classifiers.meta.Bagging -P 100 -S 1 -I 10 -W weka.classifiers.trees.J48\" />\n");
533        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"BAG-NB weka.classifiers.meta.Bagging -P 100 -S 1 -I 10 -W weka.classifiers.bayes.NaiveBayes\" />\n");
534        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"BOOST-DT weka.classifiers.meta.AdaBoostM1 -P 100 -S 1 -I 10 -W weka.classifiers.trees.J48\" />\n");
535        configFile.append(" <trainer name=\"WekaTraining\" param=\"BOOST-NB weka.classifiers.meta.AdaBoostM1 -P 100 -S 1 -I 10 -W weka.classifiers.bayes.NaiveBayes\" />\n");
536        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
537       
538        postamble(configFile);
539        return configFile.toString();
540    }
541   
542    public static String Amasaki15(Dataset dataset) {
543        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
544        preamble(configFile);
545        dataset(configFile, dataset);
546        trainers(configFile);
547       
548        configFile.append(" <preprocessor name=\"LogarithmTransform\" param=\"\" />\n");
549        configFile.append(" <preprocessor name=\"SynonymAttributePruning\" param=\"\" />\n");
550        configFile.append(" <pointwiseselector name=\"SynonymOutlierRemoval\" param=\"\" />");
551        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
552       
553        postamble(configFile);
554        return configFile.toString();
555    }
556   
557    public static String Ryu15(Dataset dataset) {
558        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
559        preamble(configFile);
560        dataset(configFile, dataset);
561        trainersLASER(configFile);
562       
563        configFile.append(" <pointwiseselector name=\"MahalanobisOutlierRemoval\" param=\"\" />\n");
564        configFile.append(" <pointwiseselector name=\"NeighborhoodFilter\" param=\"\" />\n");
565        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
566       
567        postamble(configFile);
568        return configFile.toString();
569    }
570   
571    public static String Nam15(Dataset dataset) {
572        StringBuilder configFile = new StringBuilder();
573        preamble(configFile);
574        dataset(configFile, dataset);
575        trainers(configFile);
576       
577        configFile.append(" <preprocessor name=\"CLAMIProcessor\" param=\"\" />\n");
578        configFile.append(" <eval name=\"NormalWekaEvaluation\" param=\"\" />\n");
579       
580        postamble(configFile);
581        return configFile.toString();
582    }
583}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.